Meskipun diterima bahwa manajemen ilmiah memungkinkan manajemen untuk menempatkan sumber daya untuk penggunaan dan cara terbaik, namun tidak terhindar dari kritik keras.

Sudut Pandang Pekerja

1. Pengangguran – Pekerja merasa bahwa manajemen mengurangi kesempatan kerja dari mereka melalui penggantian orang dengan mesin dan dengan meningkatkan produktivitas manusia lebih sedikit pekerja yang dibutuhkan untuk melakukan pekerjaan yang mengarah ke keluar dari pekerjaan mereka.
2. Eksploitasi – Pekerja merasa mereka dieksploitasi karena mereka tidak diberi bagian dalam peningkatan keuntungan yang disebabkan oleh peningkatan produktivitas mereka. Upah tidak naik sebanding dengan kenaikan produksi. Pembayaran upah menciptakan ketidakpastian & ketidakamanan (di luar output standar, tidak ada kenaikan tingkat upah).
3. Monoton – Karena spesialisasi yang berlebihan, para pekerja tidak dapat mengambil inisiatif sendiri. Status mereka direduksi menjadi hanya roda penggerak. Pekerjaan menjadi membosankan. Pekerja kehilangan minat dalam pekerjaan dan memperoleh sedikit kesenangan dari pekerjaan.
4. Melemahnya Serikat Buruh – Untuk semuanya sudah ditetapkan & ditentukan sebelumnya oleh manajemen. Jadi tidak ada ruang bagi serikat pekerja untuk tawar-menawar karena semuanya standar, output standar, kondisi kerja standar, waktu standar dll. Hal ini semakin melemahkan serikat pekerja, menciptakan keretakan antara pekerja yang efisien & efisien sesuai dengan upah mereka.
5. Lebih ngebut – manajemen ilmiah menetapkan output standar, waktu sehingga mereka harus bergegas dan menyelesaikan pekerjaan tepat waktu. Ini memiliki efek buruk pada kesehatan pekerja. Para pekerja mempercepat output standar itu, sehingga manajemen ilmiah mendorong para pekerja untuk bergegas menuju output dan menyelesaikan pekerjaan dalam waktu standar.

Sudut Pandang Majikan

1. Mahal – Manajemen ilmiah adalah sistem yang mahal dan investasi besar diperlukan dalam pembentukan departemen perencanaan, standarisasi, studi kerja, pelatihan pekerja. Ini mungkin di luar jangkauan perusahaan kecil. Investasi makanan berat menyebabkan peningkatan biaya overhead.
2. Memakan Waktu – Manajemen ilmiah membutuhkan revisi mental dan reorganisasi lengkap organisasi. Banyak waktu yang dibutuhkan untuk bekerja, belajar, standardisasi & spesialisasi. Selama perombakan organisasi ini, pekerjaan menderita.
3. Penurunan Kualitas